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Fragment AnalyzerTM 自动化毛细管电泳系统技术规格
Fragment Analyzer TM 自动化毛细管电泳系统设计有灵活的操作，
提供大范围的DNA/RNA片段大小和含量的高分辨率的分离。
同一个毛细管模块可以交换不同的凝胶试剂盒。
典型的分离：速度和通量
GeneRulerTM100bp、Ladder(Fermentas)、15bp（lower marker）、6000bp
（upper marker）的片段的混合物
快速运行时间：15分钟之内分离片段
快速分离父代1，父代2和杂合SSR样品。DNA片段大小313bp和423bp与10%
误差相一致。外部的峰代表的是200bp/700bp的marker。较高的700bp marker
的迁移时间为13min。
有信心检测SSRs——低至2bp的分辨率
DNF-900胶，展示了113，115，122bp的DNA片段的分辨率
分离和定量基因组DNA
基因组DNA试剂盒分离λDNA/HindIII 标记（Promega ?）和完整
的（DI）及降解（BI）基因组DNA
自动化突变检测分析
检测基因组DNA诱发（或自然）的点突变。高的灵敏度检测与简单化
的酶切过程（没有脱盐或添加EDTA）相结合，可以高效的检测突变。
流线型的酶切过程和快速分离的次数增加了超过人工TILLING 方法的通量。
DNA池（相当于8个二倍体个体）。扩增、裂解和分离。没有切开的片段
是632bp，切开的片段分别是415bp和217bp。
分析总RNA量
不需要更换毛细管芯片，流水操作，与其它方法相比减少费用。
其它应用
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DNA和RNA的定量和质量检测
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限制性消化DNA片段（CAPS 分析）
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NGS片段文库准备
通过减少分析时间增加通量：
PROSizeTM数据分析软件的设计用于简单的片段分离和片段的自动化评分和报道。
灵活的数据显示：
数据以行、列或单独的样品的组合显示在电泳图或数字胶视图。随机覆盖孔和调整对比，
显示/隐藏标记，缩放/自动定标和复制其它应用。
得分及输出
通过生成、保存和输入标志标准或模糊分析标准，给任何数据集打分的结果马上显示在
标志分析或模糊分析表格。通过鼠标功能从表格中直接输出结果，或以Excel或PDF的报
告形式输出。
Fragment AnalyzerTM主要特性和效益
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使用12或96毛细管模块——立刻直接、平行的注入和分离12或96个样品。
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缩短运行时间——<3000bp片段的分离所用时间小于15分钟。快速分离12
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个样品或整个的96孔板循环，在较短的时间内完成更多的分离。
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高敏感性——检测的较低限度为没有脱盐处理的5pg/ul，允许直接注入PCR 产物或消化的样品。
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高分离分辨率——解决了较宽范围的DNA/RNA片段的分离，分辨率低至2bp。可以开发定制胶。
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宽动态范围——覆盖了3个数量级。需要的优化比较少，每个试剂盒/胶定义了较适宜的片段含量范围。
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每个样品的花费较低——与琼脂糖/丙烯酰胺凝胶剂其它分析仪器相比，操作成本比较低。
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用户友好软件——自动给数据打分。计算片段大小和浓度，以多样化的格式显示数据，生成、保护 自定义评分参数，简单数据及报道结果。
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实时查看数据——如果需要的话，可以查看数据生成的结果，或运行中改变程序的数据。
Fragment AnalyzerTM自动化毛细管电泳系统的技术特性
较大样品通量：每个12或96个样品，较大数量为288个样品。
较大无人管理样品的能力：高至288个样品，无限制机器人手臂
较大样品容量：注入液体20ul，实际需要样品的容量低至1ul
胶的大小范围：35-500bp；35-1500bp；75-15000bp；75-20000bp
可使用的试剂盒：NGS片段分析；基因组DNA；总RNA，mRNA和TILLING
分辨率：依赖于胶，低至2bp
大小精确度：典型的5%或更好
检测灵敏度：低至5pg/ul，100pg/ul涂片
光源：1000mW LED；470mm激发波长
检测器：高灵敏度CCD，500-600mm发射光
软件：Fragment AnalyzerTM 软件控制，PROSizeTM数据分析
数据输出格式：Microsoft ? Excel ?电子表格，二进制输出选项
环境条件：室内使用，一般实验室环境为20-23℃
相对湿度：<80%（无冷凝）
电气学：100-200VAC；50-60Hz；15A（备用配置）
仪器大小：全包装61cmHx38cmWx51cmD（24x14x20内部）
仪器重量：38.5Kg（85磅）
Fragment AnalyzerTM12或96的技术参数
1.主要用途：
1.1 用于高通量动植物基因组核酸扩增产物微卫星片段大小分析，即SSR分析。
1.2 用于农业育种反向遗传学辐射或化学诱变突变体筛查，即Tilling分析。
1.3 用于常规DNA/RNA或扩增产物片段大小定性定量分析。
1.4 用于二代测序（NGS）过程中基因组DNA及文库的质控（定性定量）。
1.5 RNA定性定量分析。
1.6 质粒DNA分析、CAPS/RAPD/AFLP分析。
1.7 同时具备定性和定量的功能。
2.工作条件
2.1 环境温度: 15到25℃
2.2 电源：100-240 VAC, 50-60Hz
2.3 湿度：小于80%
3.技术指标
3.1 *自动进样系统标准要求：标准SBS格式96孔板装载样品，12或96个样品同时进样，同时检测。
3.2 *进样系统配置要求：3x 96样品进样托盘，可实现无人值守下288个样本连续进样定性分析或384个样本连续进样定量分析。
3.3 *毛细管电泳分离技术，96通道毛细管长度55cm或者80cm。片段大小分辨率2bp(小于300bp片段)
3.4 全自动仪器，每次标本分析都更换新的分离胶。
3.5 分析前全自动灌胶。
3.6 全自动进样。
3.7 全自动进Marker和Ladder。
3.8 分析结束后全自动清洗毛细管。
3.9 分析结束后全自动将毛细管置入毛细管保存液中。
3.10 标准分析时间：15分钟内完成96个样本的分析检测（小于3kbp样本）
3.11 *检出限：5 pg/μL，即2ul上述单组分标本稀释12倍后进样，可测出信噪比大于10：1的信号。
3.12 动态范围：从较小至较高优于3个数量级。
3.13 样品要求：PCR产物、基因组DNA、RNA等。样品无需纯化除盐等后处理，直接进样分析。
3.14 *可检测DNA范围：35～100000bp。较大可测到10万碱基对，可对gDNA基因组DNA进行质控检测。
* *突变检测灵敏度：可检测1000bp大小的DNA片段中1个碱基突变的存在以及8个混合样本中1个突变样本的存在。
3.16 适用的试剂盒：基因组DNA，NGS，RNA及常规片段大小分离试剂盒。
3.17 片段大小计算精度：优于5%,
3.18 光源：长寿命LED光源（标准寿命超过10年）激发波长470nm。
3.19 *检测器：高灵敏度CCD检测器，检测样本的发射波长范围：500～600nm。
3.20 具备电压进样和真空进样2种进样方式。
3.21 可同时放入2种不同类型的分离胶，2种不同类型的应用可不需要人工干预连续进行，如可连续进行DNA和RNA定性定量分析。
配套使用的试剂盒为：
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Part Number
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description
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DNF-900-K0500
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dsDNA Reagent Kit,35-500bp(500个样品)适用于35-500bp片段大小的双链DNA分离，定性及定量，内含胶、Marker、Ladder、染料及毛细管清洗液等。
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DNF-910-K0500
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dsDNA Reagent Kit,35-1500bp(500个样品)适用于35-1500bp片段大小的双链DNA分离，定性及定量，内含胶、Marker、Ladder、染料及毛细管清洗液等。
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DNF-920-K0500
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dsDNA Reagent Kit,75-15000bp(500个样品)适用于75-15000bp片段大小的双链DNA分离，定性及定量，内含胶、Marker、Ladder、染料及毛细管清洗液等。
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DNF-930-K0500
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dsDNA Reagent Kit,75-20000bp(500个样品)适用于75-20000bp片段大小的双链DNA分离，定性及定量，内含胶、Marker、Ladder、染料及毛细管清洗液等。
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DNF-479-0500
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Standard Sensitivity NGS Fragment Analysis Kit(500个样品)标准灵敏度NGS片段分析，适用于普通样品浓度情况（样品浓度较低可到1ng/ul）。NGS（二代测序）片段质控分析，片段大小范围35-6000bp，定性及定量，内含胶、Marker、Ladder、染料及毛细管清洗液等。
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DNF-486-0500
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High Sensitivity NGS Fragment Analysis Kit(500个样品)高灵敏度NGS片段分析，适用于样品浓度较低情况(样品浓度较低可到5pg/ul)。NGS（二代测序）片段质控分析，片段大小范围35-6000bp，定性及定量，内含胶、Marker、Ladder、染料及毛细管清洗液等。
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DNF-482-0500
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适用于总RNA片段大小的分离，定性及定量，内含胶、Marker、Ladder、染料及毛细管清洗液等。
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DNF-483-0500
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RNA Analysis Kit，mRNA(500个样品)适用于mRNA片段大小的分离，定性及定量，内含胶、Marker、Ladder、染料及毛细管清洗液等。
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DNF-484-0500
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Genomic DNA Analysis Kit(500个样品) 适用于基因组DNA片段大小的分离，定性及定量，较大分析片段45000bp，内含胶、Marker、Ladder、染料及毛细管清洗液等。
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DNF-910-K0500T
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Mutation Discovery Kit and Gel-dsDNA reagent Kit,35-1500bp(500个样品) 适用于基因突变的检测、Tilling分析等基于杂合异源双链不配对位点酶切法(Cell I酶切)，适合片段大小35-1500bp，定性及定量，较大分析片段45000bp，内含胶、Marker、Ladder、染料及毛细管清洗液等。
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DNF-920-K0500T
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Mutation Discovery Kit and Gel-dsDNA reagent Kit,75-15000bp(500个样品)适用于基因突变的检测、Tilling分析等基于杂合异源双链不配对位点酶切法(Cell I酶切)，适合片段大小75-15000bp，定性及定量，较大分析片段45000bp，内含胶、Marker、Ladder、染料及毛细管清洗液等。
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DNF-480-0500
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Cell I酶，专用于不配对碱基位点酶切使用，一般用于突变检测目的，比如农业应用中的多样本模板混合的Tilling分析。
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